Research Interest
Қалыпты және рак клеткаларының биофизикалық қасиеттерін сипаттау
Три Тан математика, физика және аэроғарыштық инженерияны Австралияның Сидней университетіндегі ғылым мен инженерия ғылымдарының қос деңгейлі бағдарламасы арқылы оқиды. Содан кейін Монаш университетінің есептеу биофизикасы мамандығы бойынша кандидаттық диссертациясын қорғады.
Докторантурасын аяқтағаннан кейін Три АҚШ-тың Вирджиния университетінің профессоры Майкл Ширтске қосылып, ақуыз-лигандтың өзара әрекеттесуі үшін энергияны есептеудің тиімділігі мен дәлдігін арттыру арқылы дәрі-дәрмектерді компьютерде жобалауға машықтанды. Ол жалпы дисперсияны стандартты жолмен салыстырғанда 30% төмендете алатын оңтайлы дисперсиялық жолды анықтады. Бұл нәтиже ақысыз энергияны есептеудің жылдам және дәл әдісін ұсыну арқылы дәрі-дәрмектердің есептік дизайнын жеңілдетті.
2012 жылы Три Швейцарияның Ұлттық ғылыми қорынан профессор Клеменс Кабернардтың Базель университетіндегі Биозентрумдағы зертханасында асимметриялық жасушалар бөлінуінің (ACD) механикасын зерттегені үшін беделді сыйлыққа ие болды (SystemsX.ch Transition Postdoc Fellowship). Базельде ол митоз кезінде гидростатикалық қысымды және бір клетканың кортикальды қаттылығын өлшеу үшін тірі жасушалық бейнелеуді біріктіретін атомдық күш микроскопиясын (AFM) қолдану үшін профессор Даниэль Мюллердің ETH Цюрихтегі зертханасымен күш біріктірді. Ол ACD асинхронды миозинді қайта қондыру және ішкі қысыммен басқарылатын екі сатылы процесс екенін көрсетті. Ол әрі қарай жасушаішілік қысымның асимметриялық бөлінетін жасушаларда физикалық асимметрияны күшейтуде маңызды рөл атқаратынын көрсетті. Ол сондай-ақ тірі және тіркелген жасушаларды бейнелеу деректерінің көп мөлшерін тиімді талдауға мүмкіндік беретін әртүрлі әдістер мен құралдар жиынтығын жасады. Биология кафедрасына ассистент-профессор ретінде 2019 жылдың тамызында қосылды.
Білімі:
2005 – 2009 ж.ш. Химиялық инженерия, Монаш университеті, Австралия
2001 – 2004 жж., Авиациялық (ғарыштық) инженерия, I құрмет, Сидней университеті, Австралия
2001 – 2003 жж. (Advanced) Математика және физика, Сидней университеті, Австралия
Research articles
Gallaud E, Ramdas Nair A, Horsley N, Monnard A, Singh P, Pham TT, Salvador Garcia D, Ferrand A and Cabernard C, “Dynamic centriolar localization of Polo and Centrobin in early mitosis primes centrosome asymmetry”, PLoS Biology, 18(8):e3000762, Aug 2020.
Tiantian Ji, Lina Zhang, Shengshuo Huang, Mingxi Deng, Ying Wang, Tri Thanh Pham, Clemens Cabernard, Jiguang Wang, Yan Yan, “Dynamic MAPK signaling activity underlies a transition from growth arrest to proliferation in Drosophila scribble mutant tumors”, Dis. Model Mech., 12(8), 2019.
Pham TT, Monnard A*, Helenius J*, Lund E, Lee N, Müller DJ and Cabernard C, “Spatiotemporally controlled Myosin relocalization and internal pressure generate sibling cell size asymmetry”, iScience, 13:9-19, 2019.
Roubinet C, Tsankova A*, Pham TT*, Monnard A, Caussinus E, Affolter M, Cabernard C, “Spatiotemporally separated cortical flows and spindle-induced Myosin confinement coordinately acts to establish physical asymmetry in fly neural stem cells”, Nat. Commun., 8(1), 1383, 2017 Nov 9. * Equal contribution.
Tsankova A, Pham TT, Garcia DS, Otte F, Cabernard C, “Cell cycle and polarity cues regulate biased Myosin activity and dynamics via Drosophila Rho kinase/Drok and Protein Kinase N/Pkn during asymmetric cell division”, Dev. Cell, 42(2):143-155, 2017 Jul 24.
L.N. Naden, T.T. Pham and M.R. Shirts, “Linear Basis Function Approach to Efficient Alchemical Free Energy Calculations. 1. Removal of Uncharged Atomic Sites”, J. Chem. Theory Comput., 10 (3), 1128-1149, 2014.
T.T. Pham and M.R. Shirts, “Optimal pairwise and non-pairwise alchemical pathways for free energy calculations of molecular transformation in solution phase”, J. Chem. Phys., 136(12), 124120, 2012.
T.T. Pham and M.R. Shirts, “Identifying low variance pathways for free energy calculations of molecular transformations in solution phase”, J. Chem. Phys., 135, 034114, 2011. Selected for Virtual Journal of Biological Physics Research 22, 2011.
T.T. Pham, B. Dünweg and J.R. Prakash, “Collapse dynamics of copolymers in a poor solvent: Influence of hydrodynamic interactions and chain sequence”, Macromolecules, 43, 10084, 2010.
T.T. Pham, U.D. Schiller, J.R. Prakash and B. Dünweg, “Implicit and explicit solvent models for the simulation of a single polymer chain in solution: Lattice Boltzmann vs Brownian dynamics”, J. Chem. Phys., 131, 164114, 2009. Selected for Virtual Journal of Biological Physics Research 18, 2009.
Book Chapters
Gallaud E., Pham T., Cabernard C., “Drosophila melanogaster Neuroblasts: A Model for Asymmetric Stem Cell Divisions”, Results and Problem in Cell Differentiation, 61, 183-210, 2017.
BIOL 355 Critical Research Reasoning
BIOL 456 Biology Research Design
BIOL 502 Research Methods
BIOL 520/720 Statistical Methods in Life Sciences
BIOL 590 Research Analysis in Life Sciences